Long non-coding RNAs and complex diseases: from experimental results to computational models

    Xing Chen*, Chenggang Yan*, Xu Zhang*, Zhu-Hong You

        近几十年来,LncRNAs引起了全球研究人员的广泛关注。随着实验技术和计算预测算法的快速发展,在过去几年中已经在从线虫到人类的真核生物中鉴定了数千种lncRNA。越来越多的研究证据表明,lncRNAs通过不同的机制参与细胞的整个生命周期,并在许多关键的生物过程中发挥重要作用。因此,lncRNA的突变和异常调节将导致各种人类复杂疾病的发展并不令人惊讶。在这篇综述中,我们首先简要介绍了lncRNAs的功能,5种重要的lncRNA相关疾病,5种与疾病相关的重要lncRNAs以及一些关于序列,表达,功能等的重要公共lncRNA相关数据库。如今,仅有实验报道,有限数量的lncRNA与人类疾病有关。因此,分析可用的lncRNA-疾病关联和预测潜在的人类lncRNA-疾病关联已成为生物信息学的重要任务,这将有益于人类复杂疾病机制在lncRNA水平上的理解,疾病生物标志物检测和疾病诊断,治疗,预后和预防。此外,我们引入了一些最先进的计算模型,可以有效地用于大规模识别疾病相关的lncRNA,并选择最有希望的疾病相关的lncRNA进行实验验证。我们还分析了这些模型的局限性,并讨论了开发lncRNA研究计算模型的未来方向。

        该成果发表于Briefings in Bioinformatics期刊,收录于SCI,为ESI高被引论文。

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