WBSMDA: Within and Between Score for MiRNA-Disease Association prediction

Xing Chen*, Chenggang Yan*, Xu Zhang, Zhu-Hong You , Lixi Deng, Ying Liu, Yongdong Zhang, and Qionghai Dai

越来越多的证据表明microRNA(miRNA)在功能上与各种复杂的人类疾病的发展和进展相关。然而,miRNA在多种生物过程或各种疾病中的作用及其潜在的分子机制尚未完全了解。通过整合各种异质生物数据集来预测潜在的miRNA-疾病关联对于生物医学研究具有重要意义。计算方法可以在短时间内获得潜在的miRNA-疾病关联,从而显着减少实验时间和成本。考虑到先前计算方法的局限性,我们开发了MiRNA-疾病关联预测(WBSMDA)内部和之间的模型,以预测与各种复杂疾病相关的潜在miRNA。 WBSMDA可以应用于没有任何已知相关miRNA的疾病。基于Leave-one-out交叉验证的0.8031的AUC已证明其可靠的性能。 WBSMDA进一步应用于结肠肿瘤,前列腺肿瘤和淋巴瘤,以鉴定其潜在的相关miRNA。结果,最近的实验文献分别证实了这三种疾病的前50名预测列表中90%,84%和80%的预测miRNA-疾病对。预计WBSMDA将成为潜在的miRNA-疾病关联鉴定的有用资源。

发表于Nature旗下杂志Scientific  Reports,收录于SCI,ESI高被引论文。

2016WBSMDA Within and Between Score for MiRNA-Disease Association prediction.pdf


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